Bioinformaticien(ne) en études, recherche et développement
Emploi
Gif-sur-Yvette, 91, Essonne, Île-de-France
Missions L'ingénieur.e développera, en Julia et Python, un pipeline modulaire pour analyser et scorer les protéines intrinsèquement désordonnées (IDPs), en intégrant des méthodes évolutives et de deep-learning afin d'identifier les conformations et interactions biologiquement pertinentes ; il/elle assurera également la gestion complète des données générées (collecte, structuration FAIR, documentation) et publiera le code en open-source. Activités - Développer et maintenir un code Julia/Python avec tests unitaires et intégration continue ; - Implémenter des modèles de deep-learning sur graphes pour le scoring des IDPs ; - Constituer et documenter des jeux de données conformes aux principes FAIR ; - Exploiter les clusters CPU/GPU de l'institut et les infrastructures nationales HPC ; - Rédiger documentation, rapports techniques et publications. Compétences - Solide pratique de Julia (ou forte motivation à l'acquérir) et bonne maîtrise de Python ; - Développement logiciel scientifique : Git, tests, CI, conteneurs ; - Connaissances en bioinformatique structurale et modélisation ; - Autonomie, sens de l'organisation, travail en équipe ; - Anglais scientifique niveau B1-B2 (CECRL) Contexte[...]
